Ekspedisi laut besar Dinasti Yuan (Mongol) di bawah Kubilai Khan ke Jawa Timur pada 1293 untuk menghukum Singhasari — yang berbalik jadi bencana ketika Raden Wijaya memakai pasukan Mongol menumbangkan Kediri, lalu mengusir mereka dan mendirikan Majapahit.
Perang 1666–1669 saat VOC bersekutu dengan Arung Palakka (Bugis Bone) dan Soppeng menaklukkan Kesultanan Gowa-Tallo pimpinan Sultan Hasanuddin — berpuncak pada Perjanjian Bongaya (1667) dan jatuhnya Benteng Somba Opu (1669).
Perang gerilya lima tahun (1825-1830) Pangeran Diponegoro melawan kekuasaan kolonial Belanda di Jawa Tengah.
Perang kolonial terpanjang dan termahal Belanda (1873–1904, perlawanan berlanjut hingga sekitar 1914 dan sporadis sampai 1942) melawan Kesultanan Aceh Darussalam di ujung utara Sumatra — dari serbuan gagal yang menewaskan Jenderal Köhler di Masjid Raya Baiturrahman hingga penaklukan lewat korps Marsose dan siasat Snouck Hurgronje yang memecah uleëbalang dari ulama.
Pertempuran kota berdarah 10 November 1945: arek-arek Suroboyo dan santri melawan Divisi India ke-23/ke-5 Inggris setelah tewasnya Brigjen Mallaby — kota jatuh, tetapi lahir Hari Pahlawan.